AMD

AMD COVID-19 HPC Fund to Deliver Supercomputing Clusters to Researchers Combatting COVID-19

กองทุน AMD COVID-19 HPC ส่งมอบซูเปอร์คอมพิวติ้งคลัสเตอร์ (Supercomputing Cluster) เพื่อนักวิจัยใช้ต่อสู้กับโรคระบาด COVID-19

— Donation of systems to NYU, MIT, and Rice University brings over seven petaflops of compute power to fight global pandemic —

— High performance AMD CPUs and GPUs to power focused research programs at leading institutions —

BANGKOK, Thailand — June 4, 2020 — AMD (NASDAQ: AMD) and technology partner Penguin Computing Inc., a division of SMART Global Holdings, Inc. (NASDAQ: SGH),  today announced that New York University (NYU), Massachusetts Institute of Technology (MIT) and Rice University are the first universities named to receive complete AMD-powered, high-performance computing systems from the AMD HPC Fund for COVID-19 research. AMD also announced it will contribute a cloud-based system powered by AMD EPYC and AMD Radeon Instinct processors located on-site at Penguin Computing, providing remote supercomputing capabilities for selected researchers around the world. Combined, the donated systems will collectively provide researchers with more than seven petaflops of compute power that can be applied to fight COVID-19.

“High performance computing technology plays a critical role in modern viral research, deepening our understanding of how specific viruses work and ultimately accelerating the development of potential therapeutics and vaccines,” said Lisa Su, president and CEO, AMD.  “AMD and our technology partners are proud to provide researchers around the world with these new systems that will increase the computing capability available to fight COVID-19 and support future medical research.”

The recipient universities are expected to utilize the new compute capacity across a range of pandemic-related workloads including genomics, vaccine development, transmission science and modeling. Additionally, scientists from around the world conducting COVID-19 research can request access to the remote AMD-powered cloud HPC cluster at Penguin Computing by submitting proposals to COVID-19HPC@amd.com.

University Engagement

The receiving universities are preparing their research plans and infrastructure now to receive the systems, including defining specific research projects that can have both immediate and long-term impact.

NYU

“The COVID-19 pandemic has had a profound impact on higher education research, both in terms of its direction and the need for immediate results, so the timing of this donation is particularly fortuitous, and we’re tremendously grateful to AMD,” said Russel Caflisch, director of the NYU Courant Institute of Mathematical Sciences.  “The computing resources donated by AMD will be put to use by NYU researchers from a wide range of disciplines in projects to address the many important facets of the COVID-19 crisis, including: discovery of drugs that may be therapeutic for COVID-19 and future SARS virus mutations, retrieval of relevant research results from the vast biomedical literature, analysis of medical imaging for screening of patients, and analyzing political attitudes and voting behavior in response to financial hardships.”

MIT

“Across MIT we are engaged in work to address the global COVID-19 pandemic, from that with immediate impact such as modeling, testing, and treatment, to that with medium and longer term impact such as discovery of new therapeutics and vaccines. Nearly all of this work involves computing, and much of it requires the kind of high performance computing that AMD is so generously providing with this gift of a Petaflop machine,” says Daniel Huttenlocher, dean of the MIT Schwarzman College of Computing.

Rice

At the Center for Theoretical Biological Physics, Rice researcher José Onuchic is using his previous studies on influenza A as a guide to explore how the coronavirus’s surface proteins facilitate entrance to human cells, the critical first step of infection. Another scientist, Peter Wolynes, is using principles from his foundational theories of protein folding to screen thousands of drug molecules and identify the best candidates for clinical tests based upon how well they bind to the virus’s surface proteins.

“The AMD gift will be truly transformational for Rice’s computational attack on COVID-19,” said Peter Rossky, dean of Rice’s Wiess School of Natural Sciences. “We have the methods to progress, but studies of large, complex systems are at the cutting-edge of computational feasibility. The AMD contribution of dedicated, state-of-the-art computational power will be a game changer in accelerating progress toward defeating this virus.”

AMD Ecosystem Partners

AMD has joined with well-known HPC and AI solutions firm Penguin Computing to define, build, and deliver the on-premises systems and Penguin’s Penguin on Demand (POD) cluster, powered by AMD. Penguin Computing’s POD support will be collocated in data center space donated by DataBank.   Contributions from Penguin Computing, NVIDIA, Gigabyte, and others are helping the AMD HPC Fund advance COVID-19 research.

“Penguin Computing is looking forward to supporting and contributing to the COVID-19 research efforts through this AMD collaboration. We are committed to providing our applications and technology expertise in high performance computing, artificial intelligence and data analytics to both the University on-premises and our remote POD cloud environments,” said Sid Mair, President, Penguin Computing Inc.

“Ultra-fast data speeds and smart data-processing are key to delivering insights that science demands, particularly in these challenging times,” said Gilad Shainer, senior vice-president of marketing for Mellanox networking at NVIDIA. “NVIDIA Mellanox HDR 200 gigabit InfiniBand solutions provide high data throughput, extremely low latency, and application offload engines that accelerate bio-science simulations and further the development of treatments against the coronavirus.”

Gigabyte is supplying its G290-Z21 compute nodes for the Penguin clusters, built around a single, 48-core AMD EPYC 7642 processor paired with eight Radeon Instinct MI50 GPU accelerators. The system R182-291 management nodes, also from Gigabyte, each utilize two 16-core, AMD EPYC 7302 processors.

AMD Commitment to COVID-19 Research

The AMD COVID-19 HPC fund was established to provide research institutions with computing resources to accelerate medical research on COVID-19 and other diseases. In addition to the initial donations of $15 million of high-performance computing systems, AMD has contributed technology and technical resources to nearly double the peak system  of the “Corona” system at Lawrence Livermore National Laboratory which is being used to provide additional computing power for molecular modeling in support of COVID-19 research.

Supporting Resources

— AMD มอบซูเปอร์คอมพิ้วติ้ง คลัสเตอร์ ให้กับมหาวิทยาลัยนิวยอร์ก (NYU), สถาบันเทคโนโลยีแมสซาชูเซตส์ (MIT) และมหาวิทยาลัยวิลเลียมมาร์ชไรซ์ (Rice) มอบประสิทธิภาพการประมวลผลในระดับมากกว่า 7-Petaflops เพื่อต่อสู้กับโรคระบาดที่กำลังลุกลามไปทั่วโลก

โดยมุ่งเน้นพัฒนาโปรแกรมการวิจัยของสถาบันชั้นนำ ด้วยประสิทธิภาพการประมวลผลขั้นสูงของโปรเซสเซอร์ และกราฟิกการ์ดของ AMD —

กรุงเทพฯ, ประเทศไทย – 4 มิถุนายน 2563AMD (NASDAQ: AMD) และพันธมิตรด้านเทคโนโลยี Penguin Computing Inc. ที่เป็นส่วนหนึ่งของบริษัท SMART Global Holdings, Inc. (NASDAQ: SGH) ประกาศว่า มหาวิทยาลัยนิวยอร์ก (NYU), สถาบันเทคโนโลยีแมสซาชูเซตส์ (MIT) และมหาวิทยาลัยวิลเลียมมาร์ชไรซ์ (Rice) จะเป็นมหาวิทยาลัยกลุ่มแรก ๆ ที่ได้รับระบบการประมวลผลประสิทธิภาพสูงที่ขับเคลื่อนด้วยผลิตภัณฑ์ AMD อย่างเต็มรูปแบบจากกองทุน AMD HPC Fund เพื่อวิจัยโรคระบาด COVID-19 นอกจากนี้ยังประกาศรองรับระบบคลาวด์ที่ขับเคลื่อนประสิทธิภาพด้วยโปรเซสเซอร์ AMD EPYC และ AMD Radeon Instinct ที่ตั้งอยู่ ณ Penguin Computing ส่งมอบประสิทธิภาพการประมวลผลในระยะไกล สำหรับนักวิจัยที่ได้รับการคัดเลือกจากทั่วทุกมุมโลก เมื่อผสมผสานเข้ากับระบบที่ได้รับมอบมาจาก AMD จะช่วยให้นักวิจัยมีใช้ประสิทธิภาพการประมวลผลมากกว่า 7-Petaflops เพื่อนำมาประยุกต์ใช้เพื่อต่อสู้กับโรคระบาด COVID-19 ต่อไป

ดร. ลิซ่า ซู ประธานและซีอีโอ ของ AMD กล่าวว่า “เทคโนโลยีการประมวลผลประสิทธิภาพสูงมีบทบาทสำคัญมากต่อการวิจัยสมัยใหม่ ช่วยให้เราเข้าใจถึงระบบการทำงานของไวรัสแต่ละชนิดมากยิ่งขึ้น และสุดท้ายก็จะสามารถพัฒนาวิธีการรักษาและวัคซีนที่มีประสิทธิภาพออกมาได้ AMD และพันธมิตรด้านเทคโนโลยีของเรารู้สึกยินดีที่นักวิจัยทั่วโลกสามารถใช้ระบบการประมวลผลใหม่นี้ได้ ซึ่งจะสามารถเพิ่มขีดความสามารถในการประมวลผลเพื่อต่อสู้กับโรคระบาด COVID-19 และสนับสนุนการค้นคว้าวิจัยทางการแพทย์ในอนาคต”

AMD คาดหวังว่ามหาวิทยาลัยที่ได้รับการสนับสนุนนี้สามารถใช้ประโยชน์จากศักยภาพการประมวลผลไปในงานที่  เกี่ยวข้องกับการระบาดในวงกว้างครั้งนี้ รวมถึง จีโนมิกส์ การพัฒนาวัคซีน การศึกษาและโมเดลการแพร่ระบาด นอกจากนี้ นักวิทยาศาสตร์ทั่วโลกที่กำลังวิจัยโรคระบาด COVID-19 สามารถขอเข้าถึงจากระยะไกลการประมวลผลบนระบบคลาวด์ HPC ขับเคลื่อนประสิทธิภาพการประมวลผลด้วยโปรเซสเซอร์ AMD ที่ตั้งอยู่ที่ Penguin Computing โดยส่งข้อเสนอมาที่อีเมล COVID-19HPC@amd.com

การมีส่วนร่วมของมหาวิทยาลัย

มหาวิทยาลัยที่ได้รับการสนับสนุนจาก AMD กำลังเตรียมแผนการวิจัยและโครงสร้างพื้นฐานเพื่อพร้อมรับระบบการประมวลผล รวมไปถึง การกำหนดโครงการวิจัยแบบเฉพาะเจาะจงเพื่อรองรับผลลัพธ์ที่จะได้ทั้งในระยะสั้น และระยะยาว

มหาวิทยลัยนิวยอร์ก (NYU)

รัสเซล แคฟลิช ผู้อำนวยการสถาบัน NYU Courant Institute of Mathematical Sciences กล่าวว่า “การแพร่ระบาดของโรคระบาด COVID-19 ส่งผลกระทบอย่างมหาศาลต่อการวิจัยในระดับอุดมศึกษา ทั้งในแง่ของของทิศทางการดำเนินงาน และความต้องการด้านผลลัพธ์อย่างเร่งด่วน ดังนั้น การได้รับบริจาคเทคโนโลยีในครั้งนี้จาก AMD นับเป็นเรื่องที่โชคดีเป็นพิเศษ และเรารู้สึกขอบคุณ AMD เป็นอย่างมาก ทรัพยากรการประมวลผลที่ได้รับมาจาก AMD จะนำไปใช้โดยนักวิจัยของมหาวิทยาลัยนิวยอร์ก จากหลาย ๆ สาขาวิชาที่อยู่ในโครงการการแก้ไขปัญหาสำคัญด้านต่าง ๆ ของวิกฤตโรคระบาด COVID-19 ประกอบด้วย: การค้นพบยาที่สามารถรักษาโรคระบาด COVID-19 และการกลายพันธ์ของไวรัสโรคระบาด SARS ในอนาคต, การสืบค้นผลการวิจัยที่เกี่ยวข้องจากผลงานด้านชีวการแพทย์ที่มีจำนวนมหาศาล, การวิเคราะห์ทางการแพทย์ด้วยภาพเพื่อคัดกรองผู้ป่วย และการวิเคราะห์ทัศนคติด้านการเมือง และพฤติกรรมการออกเสียงเพื่อตอบสนองอุปสรรคด้านการเงิน”

สถาบันเทคโนโลยีแมสซาชูเซตส์ (MIT)

ดาเนียล ฮัตเตนโลเกอร์ คณบดีสถาบัน MIT Schwarzman College of Computing กล่าวว่า “ที่ MIT เราทำงานร่วมกันเพื่อจัดการโรคระบาด COVID-19 ที่กำลังระบาดไปทั่วโลก งานด้านที่ให้ผลกระทบทันที เช่น การสร้างรูปแบบจำลอง การทดสอบ และการรักษา ไปจนถึงงานที่ให้ผลกระทบในระยะกลาง และระยะยาว เช่น การค้นพบการรักษาและวัคซีนใหม่ ๆ งานเหล่านี้เกือบทั้งหมดมีความเกี่ยวข้องกับการประมวลผล และส่วนใหญ่ต้องใช้การประมวลผลขั้นสูง นับเป็นความปรารถดีของ AMD ที่มอบเครื่องประมวลผลระดับ Petaflop ให้กับเรา”

มหาวิทยาลัยวิลเลียมมาร์ชไรซ์ (Rice)

โฮเซ โอนูชิค นักวิจัยจาก Center for Theoretical Biological Physics มหาวิทยาลัยวิลเลียมมาร์ชไรซ์ ใช้งานค้นคว้าของเขาก่อนหน้านี้ในเรื่องไข้หวัดใหญ่สายพันธ์ A (Influenza A) เป็นแนวทางในการค้นคว้าโปรตีนบนพื้นผิวของเชื้อไวรัส Coronavirus ว่าเอื้อต่อการแทรกซึมเข้าสู่เซลล์ของมนุษย์หรือไม่ ซึ่งเป็นขั้นตอนแรกที่สำคัญมากของการติดเชื้อ โดยนักวิทยาศาสตร์อีกท่าน ปีเตอร์ โวลนส ใช้หลักการจากทฤษฎีพื้นฐานการม้วนตัวของโปรตีนเพื่อคัดกรองโมเลกุลของยานับพันชนิด และคัดเฉพาะส่วนผสมที่ดีที่สุดเพื่อนำมาทดสอบในทางการแพทย์ โดยพิจารณาจากความสามารถในการจับตัวของโปรตีนบนพื้นผิวของไวรัส

ปีเตอร์ รอสสกี คณบดีสถาบัน Wiess School of Natural Sciences มหาวิทยาลัยวิลเลียมมาร์ชไรซ์ กล่าวว่า “ของขวัญที่ได้รับจาก AMD ในครั้งนี้ จะสร้างความเปลี่ยนแปลงอย่างใหญ่หลวงต่อระบบการประมวลผล เพื่อต่อกรกับโรคระบาด COVID-19 ของเรา เรามีแนวทางที่จะดำเนินงาน แต่ด้วยงานค้นคว้าที่มีขนาดใหญ่ และซับซ้อนอยู่ในระดับแถ วหน้าของความต้องการด้านการประมวลผล การเข้ามามีส่วนร่วมของ AMD ในด้านประสิทธิภาพการประมวลผลที่ล้ำสมัยจะเป็นตัวเปลี่ยนเกมในการพัฒนาเพื่อเอาชนะโรคระบาดในครั้งนี้”

พันธมิตรของ AMD

AMD ได้เข้าร่วมกับบริษัท Penguin Computing ซึ่งเป็นที่รู้จักในเรื่องโซลูชั่น HPC และ AI เพื่อนิยาม เพื่อสร้าง และเพื่อส่งมอบระบบแบบ on-premises และคลัสเตอร์ Penguin on Demanc (POD) ของบริษัท Penguin ซึ่งขับเคลื่อนประสิทธิภาพการประมวลผลด้วยโปรเซสเซอร์ AMD โดยการรองรับของคลัสเตอร์ POD บริษัท Penguin จะตั้งอยู่ในพื้นที่ดาต้าเซ็นเตอร์ที่ DataBank สนับสนุน การได้รับการสนับสนุนจาก Penguin Computing, NVIDIA, Gigabyte และพันธมิตรรายอื่น ๆ ช่วยให้กองทุน AMD HPC Fund สามารถทำให้การพัฒนาการวิจัยโรคระบาด COVID-19 ก้าวหน้าต่อไป

ซิด แมร์ ประธานบริษัท Penguin Computing กล่าวว่า “เราต้องการจะสนับสนุน และให้ความช่วยเหลืองานการวิจัยโรคระบาด COVID-19 ผ่านความร่วมมือกับ AMD เรามุ่งมั่นที่จะให้บริการผ่านแอปพลิเคชั่น และความเชี่ยวชาญด้านเทคโนโลยีของเราในด้านการประมวลผลขั้นสูง ปัญญาประดิษฐ์ และการวิเคราะห์ข้อมูลให้กับทั้งในส่วนของมหาวิทยาลัย และการประมวลผลระยะไกลบนระบบคลาวด์ผ่านคลัสเตอร์ POD”

กีแลด เชเนอร์ รองประธานอาวุโสฝ่ายการตลาดเครือข่าย Mellanox บริษัท NVIDIA กล่าวว่า “ความเร็วของข้อมูลที่เร็วเป็นพิเศษ และการประมวลผลข้อมูลรูปแบบอัจฉริยะจะเป็นกุญแจสำคัญในการนำเสนอข้อมูลเชิงลึกที่เป็นที่ต้องการในด้านวิทยาศาสตร์ โดยเฉพาะอย่างยิ่งในช่วงเวลานี้ โดยโซลูชั่น NVIDIA Mellanox HDR 200 Gigabit InfiniBand ส่งมอบความสามารถด้านการรับ-ส่งข้อมูลที่สูง ความหน่วงต่ำมาก และแอปพลิเคชั่นแบบ offroad engine ที่เร่งขั้นตอนการจำลองทางวิทยาศาสตร์ชีวภาพ และพัฒนาการรักษา และต่อต้านโรคระบาด Coronavirus”

Gigabyte เป็นผู้จัดหาโหนดการประมวลผล G290-Z21 สำหรับคลัสเตอร์ของ Penguin สร้างขึ้นด้วยคอร์ประมวลผลแบบซิงเกิลคอร์ จำนวน 48 คอร์ บนโปรเซสเซอร์ AMD EPYC 7642 จับคู่กับกราฟิกการ์ด Radeon Instinct จำนวน 8 ตัว โดยโหนดสำหรับการจัดการระบบ R182-291 นั้นได้รับการสนับสนุนจาก Gigabyte ซึ่งในแต่ละเครื่องใช้โปรเซสเซอร์ AMD EPYC 7302 พร้อมคอร์ประมวลผล 16 คอร์

ความมุ่งมั่นของ AMD ในการวิจัยโรคระบาด COVID-19

กองทุน AMD COVID-19 HPC จัดตั้งขึ้นเพื่อให้สถาบันวิจัยต่าง ๆ มีแหล่งข้อมูลสำหรับการประมวลผล เพื่อพัฒนางานวิจัยทางการแพทย์เรื่องโรคระบาด COVID-19 และโรคอื่น ๆ นอกเหนือจากการบริจาคระบบการประมวลผลประสิทธิภาพสูง AMD มูลค่า 15 ล้านเหรียญสหรัฐฯ ในครั้งแรกนี้แล้ว AMD ยังสนับสนุนเทคโนโลยี และทรัพยากรด้านเทคนิคเพื่อเพิ่มประสิทธิภาพการประมวลผลเกือบสองเท่า ให้กับห้องปฎิบัติการแห่งชาติ Lawrence Livermore National Laboratory ซึ่งนำมาใช้เพื่อเพิ่มประสิทธิภาพการประมวลผลการสร้างแบบจำลองโมเลกุลเพื่อสนับสนุนการวิจัยโรคระบาด COVID-19

Supporting Resources